Мікробіологічна лабораторія укомплектована сучасним обладнанням імпортного та вітчизняного виробництва. В лабораторії працюють кваліфіковані фахівці, що мають досвід роботи з випробувань харчової продукції та сировини, дієтичних добавок, парфумерно-косметичної продукції, проводить випробування  за такими показниками:  

-мезофільні аеробні і факультативно анаеробні мікроорганізми (МАФАМ), 
 -бактерії групи кишкових паличок (БГКП), 
 -Staphylococcus aureus,
 -Escherichia coli, 
 -Bacillus cereus,
 -Clostridium perfringens,
 -бактерії роду Proteus,
 -Pseudomonas aeruginosa,
 -Listeria monocytogenes,
 -сульфітредукуючі клостридії,
 -молочнокислі бактерії,
 -біфідобактерії,
 -дріжджі, 
 -плісеневі гриби,
 -ентерококи,
 -бактерії родини Еnterobacteriaceae,
 -вміст плісеней по Говарду,
 -патогенні мікроорганізми в т.ч. сальмонели,
 -промислова стерильність,
 -антибіотики: тетрациклінова група, стрептоміцин, пеніцилін.